در مورد پناه گاه بودن مسجد در بروز حوادث و گرفتاری ها باید گفت: هر انسانی در گیر و دار مسائل زندگی، طبعا با بعضی از ناراحتی ها و مشکلات مواجه خواهد شد.گاهی این ناراحتی ها به قدری شدید است که به صورت غم و اندوهی جانکاه ظاهر می شود و گلوی انسان را به قصد از پای درآوردن، می فشارد. پناه بردن به مسجد و نماز و دعا در چنین اوقاتی، یکی از راه های التیام و رفع این گونه ناراحتی ها است. امام صادق (ع) در سخنی می فرماید: « چه چیز شما را مانع مىشود که هر گاه اندوهى از اندوههاى دنیا بر کسى از شما وارد شود از اینکه وضو بسازد، سپس داخل مسجد شود و دو رکعت نماز بجاى آورد و در آن نماز خداوند را بخواند، آیا نشنیدهاى که خداى متعال می فرماید: (طلب یارى نمائید به واسطه صبر و نماز، در سختیها و گرفتاریها)[۲۴۷]».[۲۴۸]
همچنین در روایات مسجد به عنوان پناه گاهی برای اوقات بروز حوادث و وقایع هولناک طبیعی ذکر شده است. امام باقر (ع) از قول پیامبر اکرم (ص) نقل می کند که آن حضرت در مورد وقوع خسوف و کسوف فرمودند: « همانا خورشید و ماه دو نشانه از نشانههاى خداوند متعال هستند، که با تقدیر الهی حرکت مىکنند و فرمانبردار و مطیع امر خداى متعال هستند و به سبب مردن و زندگى یا زنده شدن کسى منکسف نمىشوند و نمی گیرند، پس هر گاه یکى از آن دو (خورشید و ماه) گرفت، در این صورت وقت را از دست ندهید و (براى خواندن نماز) در رفتن به مساجد خود، پیش دستى کنید (بشتابید)».[۲۴۹]
به همین دلیل فقها با استناد به این گونه روایات، یکی از مستحبات نماز آیات را بجای آوردن آن، در مساجد ذکر کرده اند.[۲۵۰]